Les Missions de Pacification sont un terme qui désigne toutes les opérations de l'Armée sur des planètes inconnues ou à la situation devenue instable et sans nouvelles apparentes, habitées ou non.
Le terme, flou, est volontairement utilisé tel quel par l'Empire, qui n'a donc pas besoin de déclarer officiellement les réels aboutissants de ces missions. On sait que le Massacre des Turg'Mäls était considéré comme une "Mission de Pacification".
Bien que l'aspect controversé de ces missions est la principale source de débats, elles restent néanmoins très effectives et permet parfois de sauver des rescapés éventuels (Certaines planètes inconnues étaient "peuplées" par quelques petits groupes de colons dont le vaisseau avait disparu de tous radars)
Ces missions sont principalement soutenues par les corporations, qui voient dans l'exploration et la colonisation de nouvelles planètes des sources de revenues évidentes. Argument valable pour l'Empire, qui y déploie une tentacule supplémentaire. C'est donc un véritable réseau, presque commercial, que développent ces opérations de pacification.
Bien que la majorité de ces explorations soient des succès où les pertes de l'Armée sont minimes, on recense cependant de réels échecs, voir même des situations très troublantes qui n'ont pas vu l'objet de nouvelles missions (notamment la Bataille de Tsarinni)